MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuG_Q212 chromosome

Total Repeats: 10019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011527	G	6	6	1628	1633	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011527	TAGA	2	8	3919	3926	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011527	AGA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011527	AAT	2	6	4016	4021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011527	A	7	7	4032	4038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011527	A	7	7	4078	4084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011527	TCC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011527	GCC	2	6	6669	6674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011527	AGCGA	2	10	8072	8081	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011527	GTG	2	6	8758	8763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011527	CGT	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011527	CTG	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011527	G	6	6	8849	8854	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011527	CT	3	6	14668	14673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011527	A	6	6	14991	14996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011527	T	7	7	15029	15035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011527	TAAA	2	8	15076	15083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011527	A	6	6	15122	15127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011527	TTTAT	2	10	15878	15887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011527	TGCGC	2	10	17801	17810	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011527	GC	3	6	17818	17823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011527	C	6	6	18035	18040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_011527	AAT	2	6	18070	18075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011527	GAC	2	6	18098	18103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011527	CAC	2	6	18126	18131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_011527	GGGT	2	8	18132	18139	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011527	AG	3	6	18188	18193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011527	T	6	6	18274	18279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011527	TCA	2	6	23110	23115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011527	AGC	2	6	23165	23170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011527	CGA	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011527	TTTA	2	8	23227	23234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011527	CTG	2	6	23242	23247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011527	A	8	8	23312	23319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011527	TA	3	6	23338	23343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011527	A	6	6	23347	23352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011527	TAA	2	6	23365	23370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011527	TAA	2	6	23377	23382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011527	TTAAT	2	10	23397	23406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011527	GCGAA	2	10	23445	23454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011527	TTG	2	6	23466	23471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011527	GCTTC	2	10	26005	26014	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011527	TTG	2	6	26036	26041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011527	GCA	2	6	26079	26084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011527	CAG	2	6	26248	26253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011527	TGT	2	6	26256	26261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011527	GGA	2	6	26290	26295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011527	TTA	2	6	28426	28431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011527	T	6	6	28432	28437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011527	TCGCT	2	10	28451	28460	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_011527	CT	3	6	28473	28478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011527	AGCGA	2	10	28496	28505	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011527	AATTC	2	10	28515	28524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011527	A	6	6	28586	28591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011527	TAT	2	6	28595	28600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011527	T	8	8	28602	28609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011527	A	7	7	28618	28624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011527	GTT	2	6	28648	28653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011527	TAG	2	6	28662	28667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011527	ATT	2	6	28697	28702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011527	TTG	2	6	28718	28723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011527	CGA	2	6	28734	28739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011527	CAG	2	6	28756	28761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011527	GAAA	2	8	28762	28769	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011527	A	7	7	37461	37467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011527	T	6	6	38162	38167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011527	A	6	6	38168	38173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011527	CTATC	2	10	41533	41542	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011527	CACC	2	8	41545	41552	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_011527	TAA	2	6	41984	41989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011527	GAT	2	6	42001	42006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011527	TCT	2	6	42013	42018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011527	ACG	2	6	42047	42052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011527	TC	3	6	42068	42073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011527	ATT	2	6	42098	42103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011527	CAA	2	6	42107	42112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011527	T	6	6	42158	42163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011527	TGTT	2	8	42231	42238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011527	A	6	6	42256	42261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011527	TTC	2	6	42272	42277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011527	GCTT	2	8	42335	42342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011527	ACC	2	6	42400	42405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011527	TTC	2	6	42413	42418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011527	CCA	2	6	42437	42442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011527	TCA	2	6	42462	42467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011527	ATTGG	2	10	42482	42491	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011527	TTCT	2	8	42505	42512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011527	TTG	2	6	42919	42924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011527	AGT	2	6	42939	42944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011527	TGA	2	6	43022	43027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011527	T	6	6	43031	43036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011527	A	6	6	43123	43128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011527	CGG	2	6	43142	43147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011527	T	6	6	43171	43176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011527	GAT	2	6	43230	43235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011527	CTT	2	6	43266	43271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011527	GA	3	6	43274	43279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011527	TTA	2	6	43394	43399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011527	TAA	2	6	43429	43434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011527	TAA	2	6	43449	43454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011527	CGA	2	6	43482	43487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011527	ATA	3	9	43496	43504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011527	TTC	2	6	43534	43539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011527	ACC	2	6	43561	43566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_011527	CTG	2	6	43727	43732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011527	AAC	2	6	43741	43746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011527	TCA	2	6	43814	43819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011527	A	6	6	43819	43824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011527	ATCA	2	8	43873	43880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011527	GCTT	2	8	43952	43959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011527	ATCA	2	8	43960	43967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011527	GAT	2	6	44029	44034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011527	TCA	2	6	44046	44051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011527	GCT	2	6	44052	44057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011527	A	7	7	44099	44105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011527	CCA	2	6	44115	44120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011527	AAT	2	6	44137	44142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011527	CTT	2	6	44161	44166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011527	T	6	6	44185	44190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011527	T	8	8	44225	44232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011527	TC	3	6	44237	44242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011527	AAG	2	6	45534	45539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011527	CGT	2	6	45863	45868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011527	G	8	8	45878	45885	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011527	GC	3	6	45889	45894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011527	ATA	2	6	45959	45964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011527	GC	3	6	48605	48610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011527	GC	3	6	48614	48619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011527	TTC	2	6	48625	48630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011527	GAT	2	6	48641	48646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011527	ATAA	2	8	49532	49539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011527	CGA	2	6	51029	51034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011527	TCAA	2	8	51079	51086	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011527	AAG	2	6	51130	51135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011527	A	6	6	51570	51575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011527	AAG	2	6	53010	53015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011527	CAT	2	6	53038	53043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011527	TGCGC	2	10	53147	53156	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011527	GC	3	6	53164	53169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011527	A	6	6	53632	53637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011527	GTC	2	6	54730	54735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011527	GCC	2	6	54747	54752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_011527	A	6	6	57097	57102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011527	TTTA	2	8	57134	57141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011527	TC	3	6	57886	57891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011527	A	6	6	57950	57955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011527	GGA	2	6	57956	57961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011527	T	6	6	59714	59719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011527	AATA	2	8	59724	59731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011527	CGT	2	6	59741	59746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_011527	CGT	2	6	59763	59768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011527	TTAA	2	8	59826	59833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011527	A	6	6	59860	59865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011527	AAT	2	6	59910	59915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011527	AGA	2	6	59928	59933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011527	T	7	7	59940	59946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011527	AAAAG	2	10	59988	59997	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011527	ATT	2	6	60057	60062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011527	ATC	2	6	60458	60463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_011527	AAT	2	6	60930	60935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011527	T	8	8	60953	60960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011527	AAATTA	2	12	60988	60999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011527	ATAAA	2	10	61050	61059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011527	T	7	7	61083	61089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011527	GTT	2	6	61093	61098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011527	TTA	2	6	61125	61130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_011527	TAA	2	6	61157	61162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_011527	TAA	2	6	61169	61174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_011527	TTAA	2	8	62126	62133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011527	AAAT	2	8	62143	62150	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011527	A	6	6	62165	62170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_011527	TCT	2	6	62313	62318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_011527	GA	4	8	62368	62375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
180	NC_011527	ACGG	2	8	62395	62402	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
181	NC_011527	TAA	2	6	62435	62440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_011527	ATT	2	6	62532	62537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_011527	TAT	2	6	63838	63843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_011527	CCTT	2	8	63845	63852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
187	NC_011527	TTA	2	6	63865	63870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_011527	TAC	2	6	63900	63905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_011527	AGG	2	6	63923	63928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_011527	TAA	2	6	64837	64842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_011527	TATT	2	8	71596	71603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_011527	ATAAG	2	10	71656	71665	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
279	NC_011527	GAA	2	6	71666	71671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_011527	TGT	2	6	71704	71709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_011527	TGT	2	6	71711	71716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_011527	TC	3	6	71820	71825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
283	NC_011527	TAA	2	6	71837	71842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_011527	GGT	2	6	71905	71910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_011527	T	7	7	71958	71964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_011527	TAA	2	6	72026	72031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_011527	TAA	2	6	72089	72094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_011527	TAT	2	6	72096	72101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011527	TAT	2	6	72129	72134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011527	ATC	2	6	72169	72174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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